{"id":304,"date":"2006-10-18T22:44:00","date_gmt":"2006-10-18T20:44:00","guid":{"rendered":"https:\/\/matthieu.sarter.fr\/blog\/aidez-la-recherche-scientifique"},"modified":"2014-05-10T22:50:23","modified_gmt":"2014-05-10T20:50:23","slug":"aidez-la-recherche-scientifique","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/matthieu.sarter.fr\/blog\/aidez-la-recherche-scientifique\/","title":{"rendered":"Aidez la recherche scientifique"},"content":{"rendered":"<p>Savez-vous que votre ordinateur passe le plus clair de son temps \u00e0 ne rien faire ?<br \/>\n<!--more--><\/p>\n<div class=\"post-content\">\n<p>Lorsque vous utilisez votre ordinateur, le processeur passe la majorit\u00e9 du temps \u00e0 ne rien faire, dans le processus \u00ab\u00a0idle\u00a0\u00bb du syst\u00e8me. Plut\u00f4t que de le laisser se tourner les pouces ainsi, pourquoi ne pas utiliser cette puissance de calcul inexploit\u00e9e pour la fournir \u00e0 ceux qui en ont besoin\u00a0?<\/p>\n<p>C&rsquo;est l&rsquo;id\u00e9e qu&rsquo;ont eu plusieurs groupes de scientifiques il y a quelques ann\u00e9es\u00a0: plut\u00f4t que d&rsquo;effectuer les gros calculs scientifiques sur des supercalculateurs ou des clusters d&rsquo;un prix exorbitant, ils ont d\u00e9velopp\u00e9s des petits logiciels permettant de r\u00e9partir le travail sur des millions d&rsquo;ordinateurs personnels via Internet (grilles).<\/p>\n<p>Le principe est simple\u00a0: le programme se connecte \u00e0 un serveur central, t\u00e9l\u00e9charge une unit\u00e9 de donn\u00e9es \u00e0 traiter puis utilise la puissance inutilis\u00e9e de l&rsquo;ordinateur en s&rsquo;ex\u00e9cutant en priorit\u00e9 basse. Une fois les donn\u00e9es trait\u00e9es, le r\u00e9sultat est renvoy\u00e9 au serveur et une nouvelle unit\u00e9 de donn\u00e9es est r\u00e9cup\u00e9r\u00e9e.<\/p>\n<p>Tout ceci fonctionne de mani\u00e8re totalement transparente, sans impact sur les performances de la machine (j&rsquo;utilise l&rsquo;un de ces logiciels depuis plus de 5 ans sans avoir remarqu\u00e9 la moindre chute de performance quand il s&rsquo;ex\u00e9cute) et quasiment sans intervention de l&rsquo;utilisateur. Il n&rsquo;est pas non plus n\u00e9cessaire d&rsquo;avoir une b\u00eate de course, m\u00eame une machine vieille de quelques ann\u00e9es \u00e0 de la puissance \u00e0 revendre et la quantit\u00e9 de donn\u00e9es \u00e0 transf\u00e9rer est largement acceptable m\u00eame avec une connexion 56K.<\/p>\n<p>Pour pousser un peu les utilisateurs, la plupart des communaut\u00e9s de calcul proposent \u00e9galement un syst\u00e8me de classement et d&rsquo;\u00e9quipe, favorisant l&rsquo;\u00e9mulation et la course au temps de calcul fourni.<\/p>\n<p>Voici une liste des grilles les plus populaires\u00a0:<\/p>\n<ul>\n<li><a title=\"Seti@Home\" href=\"http:\/\/setiathome.ssl.berkeley.edu\/\" target=\"_blank\" hreflang=\"fr\">Seti@Home<\/a>\u00a0: traitement des donn\u00e9es issues des radiot\u00e9lescopes du programme SETI (Search for Extra-Terrestrial Intellligence) pour aider E.T. \u00e0 t\u00e9l\u00e9phoner maison \ud83d\ude09 Lanc\u00e9 par l&rsquo;universit\u00e9 de Berkeley en mai 1999, il est l&rsquo;un des pr\u00e9curseurs des grilles de calcul et r\u00e9uni aujourd&rsquo;hui environ 1 millions de machines pour une puissance exploitable de l&rsquo;ordre de 250 Teraflops (ce qui le placerait au second rang de supercalculateurs). La plateforme SETI a \u00e9t\u00e9 remplac\u00e9e depuis peu par la plateforme Open Source BOINC (Berkeley Open Infrastructure for Network Computing) qui pr\u00e9sente l&rsquo;avantage d&rsquo;\u00eatre ouverte \u00e0 de <a title=\"BOINC\" href=\"https:\/\/boinc.berkeley.edu\/\" target=\"_blank\" hreflang=\"en\">nombreux autres projets de recherche<\/a>.<\/li>\n<li><a title=\"Folding@Home\" href=\"http:\/\/folding.stanford.edu\/\" target=\"_blank\" hreflang=\"en\">Folding@Home<\/a>\u00a0: moins connu mais \u00e0 priori plus utile que SETI, Folding analyse le repliement des prot\u00e9ines humaines pour aider la m\u00e9decine \u00e0 mieux comprendre et traiter certaines maladies li\u00e9es \u00e0 ces prot\u00e9ines. Le projet est maintenu par l&rsquo;universit\u00e9 de Stanford.<\/li>\n<li><a title=\"Genome@Home\" href=\"https:\/\/genomeathome.stanford.edu\/\" target=\"_blank\" hreflang=\"en\">Genome@Home<\/a>\u00a0: utilisant la m\u00eame plateforme que Folding, Genome s&rsquo;occupe comme son nom l&rsquo;indique du d\u00e9codage du g\u00e9nome humain, dans le cadre de la recherche contre les maladies g\u00e9n\u00e9tiques.<\/li>\n<li><a title=\"Grid.org\" href=\"http:\/\/www.grid.org\" target=\"_blank\" hreflang=\"en\">Grid.org<\/a>\u00a0: Grid est l&rsquo;une des principales plateformes priv\u00e9es. Lanc\u00e9e initialement pour la recherche sur le cancer, cette plateforme travaille actuellement sur le repliement des prot\u00e9ines humaines.<\/li>\n<li><a title=\"World Community Grid\" href=\"http:\/\/www.worldcommunitygrid.org\/\" target=\"_blank\" hreflang=\"fr\">World Community Grid<\/a>\u00a0: issue d&rsquo;un partenariat entre IBM et United Devices (Grid.org), cette plateforme utilise le m\u00eame client que la plateforme Grid, mais dans une version l\u00e9g\u00e8rement r\u00e9actualis\u00e9e. Elle h\u00e9berge actuellement 3 projets m\u00e9dicaux\u00a0: recherche sur le cancer, le repliement des prot\u00e9ines et le SIDA.<\/li>\n<\/ul>\n<p>Personnellement j&rsquo;utilise 2 plateformes\u00a0: Folding@Home depuis environ 1 an et World Community Grid depuis 15 jours (apr\u00e8s avoir utilis\u00e9 Grid pendant 5 ans). N&rsquo;h\u00e9sitez pas \u00e0 me rejoindre\u00a0!<\/p>\n<p>Deux petites remarques pour finir\u00a0:<\/p>\n<ul>\n<li>la plupart de ces plateformes n&rsquo;utilisent qu&rsquo;un seul thread, donc si vous avez une machine multi-cores, utilisez plusieurs plateformes pour ne pas laisser un des core regarder son coll\u00e8gue travailler\u00a0!<\/li>\n<li>d\u00e9sactivez les applications de calcul quand vous travaillez sur batteries\u00a0: elles emp\u00eachent le processeur de passer en mode \u00e9conomique et plombent l&rsquo;autonomie&#8230;<\/li>\n<\/ul>\n<\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Savez-vous que votre ordinateur passe le plus clair de son temps \u00e0 ne rien faire ?<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"jetpack_post_was_ever_published":false,"_jetpack_newsletter_access":"","_jetpack_dont_email_post_to_subs":false,"_jetpack_newsletter_tier_id":0,"_jetpack_memberships_contains_paywalled_content":false,"_jetpack_memberships_contains_paid_content":false,"footnotes":""},"categories":[20],"tags":[],"class_list":["post-304","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-geekeries"],"jetpack_featured_media_url":"","jetpack_sharing_enabled":true,"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/matthieu.sarter.fr\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/304","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/matthieu.sarter.fr\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/matthieu.sarter.fr\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/matthieu.sarter.fr\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/matthieu.sarter.fr\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=304"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/matthieu.sarter.fr\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/304\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/matthieu.sarter.fr\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=304"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/matthieu.sarter.fr\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=304"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/matthieu.sarter.fr\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=304"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}